De Mega 2560 is ontworpen voor gebruik bij meer ingewikkelde projecten. De Arduino Mega 2560 is een microcontrollerboard dat op de ATmega2560 is gebaseerd. Het heeft 54 digitale in- en uitgangen, waarvan 15 als PWM uitgang gebruikt kan worden, 16 analoge ingangen en 4 UART's (seriële poorten). Verder heeft het board een 16 MHz kristal oscillator, een USB aansluiting, een voedingsaansluiting, een ICSP header-connector en een reset knopje.